Naudingos pastabos apie imunogenų epitopą
Naudingos pastabos apie imunogenų epitopą!
Dauguma imunogenų yra sudarytos iš daugelio molekulių tipų.
Tačiau tik nedaugelis šių molekulių veikia kaip imunogenas. Netgi vienoje imunogeninėje molekulėje imuninis atsakas nėra nukreiptas prieš visą molekulę, bet tik prieš kelias aminorūgščių liekanas molekulėje.
Aminorūgščių, kurias atpažįsta imunoglobulinas arba T ląstelių receptorius (TCR), rinkinys yra vadinamas epitopu (anksčiau vadinamu antigeniniu determinantu). Viena imunogeninė molekulė gali turėti vieną ar daugiau skirtingų epitopų (6.1 pav.).
6.1 pav. Diagrama rodo skirtingų epitopų buvimą antigene.
Šioje diagramoje antigene yra parodyti trys skirtingi epitopai. Peptidiniai epitopai skiriasi vienas nuo kito aminorūgščių sekomis, todėl jie skiriasi savo 3-dimensijos struktūra. Kadangi epitopai skiriasi vienas nuo kito, prieš epitopus indukuoti antikūnai taip pat skiriasi. B ląstelėje esantis paviršiaus imunoglobulinas (slg; B ląstelių receptorius) prisijungia prie epitopo ir prisijungimas vyksta tarp epitopo aminorūgščių ir komplementarinių aminorūgščių sekų hipervariuotame slg regione.
Baltymų aminorūgščių liekanos linkusios suslėgti į kompaktiškas mases. Bendras kiekvieno baltymo lankstymo modelis yra standus. Taigi aminorūgščių liekanos, eksponuotos sulankstytos masės paviršiuje, užima fiksuotas vietas vienas kito atžvilgiu. Rentgeno kristalogramos parodė, kad antikūnai liečiasi su aminorūgščių liekanomis proteino antigeno paviršiuje. Aminorūgščių, su kuriomis kiekvienas antikūnų kontaktas svyruoja nuo 3-20, skaičius.
i. Daugeliu atvejų visos epitopo aminorūgščių liekanos yra tiesiškai. Tokie epitopai vadinami tiesiniais (arba nuosekliais) epitopais. Šilumos denatūravimas nekeičia likučių padėties tiesinėje epitopoje. Taigi, net ir po kaitinimo, tiesiniai epitopai derinami su atitinkamais antikūnais (6.2 pav.).
ii. Kai kurie epitopai nėra formuojami tiesinėmis aminorūgštimis. Dėl aminorūgščių grandinės sulankstymo pobūdžio, skirtingose grandinės vietose esančios amino rūgštys yra artimesnės viena kitai. Epitopą gali sudaryti aminorūgštys iš skirtingų polipeptidinės grandinės dalių ir yra šalia viena kitos. Šis epitopas vadinamas konformaciniu epitopu.
Aminorūgščių liekanos, sudarančios konformacinį epitopą, yra toli vienas nuo kito pirminėje aminorūgščių sekoje, bet tretinėje struktūroje yra viena šalia kitos. Kai baltymas su konformaciniu epitopu yra šildomas, atsiranda baltymų grandinės denatūracija ir aminorūgščių grandinė praranda trimatę sulankstymą. Dėl karščio epitopą sudarančios aminorūgštys yra atskirtos viena nuo kitos, todėl epitopas prarandamas. Todėl antikūnai, susidarę prieš konformacinį epitopą, negali prisijungti prie denatūruoto antigeno (6.2 pav.).
